Le Musée d'Histoire Naturelle de la Forêt Pétrifiée de Lesvos a été créé en 1994 pour l'étude, la recherche, la promotion, la préservation et la protection de la Forêt Pétrifiée de Lesvos, un Monument Naturel Unique du passé.

L'année 2000 est marquée par la création du réseau des Géoparcs européens. L'objectif de ce réseau étant de promouvoir le développement du Géotourisme au niveau européen. La Forêt Pétrifiée de Lesvos est un membre fondateur du Réseau de Géoparcs européens.

En 2001, le Musée d'Histoire Naturelle  de la Forêt Pétrifiée de Lesvos a reçu le “Eurosite Management Award” pour sa gestion efficace de la Forêt Pétrifiée de Lesvos. En février 2004, la Forêt Pétrifiée de Lesvos a été intégrée dans le Réseau Mondial des Géoparcs de l'UNESCO.

Le Musée d'Histoire Naturelle de Lesvos, grâce à sa participation au programme RACCE, propose l'échange d'expériences et des interventions pilotes pour la promotion de la protection du public contre l'activité sismique. Le musée, en tant qu'organisme, peut démontrer les résultats et mettre immédiatement en œuvre les nouvelles pratiques éducatives issues des programmes éducatifs organisés pour les enfants. En outre, ils peuvent également informer les citoyens des nouvelles données sur le phénomène sismique.